非核糖体肽(Nrps)是一类结构复杂的天然产物,具有多种性质,如毒素、铁磷、色素、抗生素、细胞抑制剂、免疫抑制剂或抗癌药物。这些肽是在非核糖体肽合成酶(Nrps)复合物上合成的,它们作为模板和生物合成机制,通过一种与核糖体无关的硫模板机制合成。NPRS以模块化结构排列,每个模块至少使用三个结构域来完成肽延伸周期:缩合(C)、腺苷化(A)和硫醇化(T)。在伸长过程中,生长的肽中间体仍以共价方式与T结构域相连。最后,完全拉长的肽的链释放是通过多种机制进行的,例如C-末端硫酯酶(TE)结构域,或通过末端还原酶(Re)。
有趣的是,有一组NRPs生物合成基因簇(BGCs)编码缺乏C末端释放结构域的NRPS,而且它们都不例外地含有一个未知的ORF,其与具有特征的青霉素结合蛋白(PBP)、碱性D-肽酶(ADP)具有21%-23%的同源性。已鉴定的BGCs负责产生具有生物活性的NRP代谢物,包括环八肽、苏果糖(SGM)-A至-E(1-5)和海洋链霉菌产生的线性欺骗肽SGM-F。JAMM 992或S.Albus J 1074,链霉菌属氯化环六肽,ulleungmycins B。KCB13F003、环六肽、深海衍生的东莨菪碱(SCSIO)ZJ 46,以及吸水菌NRRL 30439的脂糖肽。与nrp bgcs相关的这些未知的pbp样orfs的研究,如确定、mppk、dsaj和Ulm 16,可能会发现nrp生物合成途径中一个不寻常的肽卸载酶家族。
在这里,研究人员证实surE对于通过遗传实验生产SGM至关重要。生化表征证明重组酶SurE可以从相应的SNAC底物产生主要产物SGM-A和-F,表明SurE是一种独立的类硫酯酶。 SurE还显示出相当大的底物可塑性,具有扩展的环或不同的氨基酸组成以产生不同的环肽,突出了化学酶应用的潜力。通过定点突变,可以确定的关键残基。最后,生物信息学分析表明,确证SurE同源物在细菌中广泛分布,提示了NRP在自然界中释放的一般机制。
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最后编辑时间为: 2020-04-08 00:20 Wednesday
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